《昌吉学院学报》是昌吉学院主管主办的综合学术刊物，双月刊，1985年创刊，原名为《西部学坛》、《昌吉师专学报》。1999年，经国家新闻出版总署批准，在全国公开出版发行，2001年更名为《昌吉学院学报》，国内统一刊号是CN 65-1226/G4，国际标准刊号是ISSN 1671-6469。

《昌吉学院学报》作为学院的学术窗口和科研园地，以开展学术理论研究，提高教学科研水平，服务地方经济文化建设为宗旨。倡导理论联系实际、实事求是的优良学风，重视基础理论研究和实际应用研究，不断探索创新，为繁荣学术、充分展示了我院的科研成果和科研实力，对学院的教学和科研工作起到了很好的促进作用，为地方的经济建设和社会发展做出了较大的贡献。主要刊载政治、财经、文史、哲学、法律、语言文学、民族学等方面的研究论文及调查报告。主要设有重点栏目“女性文化研究”和“北庭西域研究”、“回族研究”两个特色专栏，以及“语言文学研究”、“政经法哲社科综合研究”、“教育教学心理学研究”等栏目。获奖情况：2000年获新疆首届期刊奖优秀文章编辑二等奖；2002年在第二届新疆期刊奖评比中获优秀文章编辑三等奖和装帧设计三等奖。